悠久之树中队伍的阵容配置十分重要，游戏中的角色分为火、水、风、土、光、暗六种属性，而每个属性都有自己的阵容队伍体系，一般情况下的队伍配置中很少会混用不同属性的角色，这也导致了悠久之树在配队方面有一定的局限性，即便是欧皇也不能把四个SSR角色凑一队拿来挑战各类BOSS。
目前在悠久之树的版本中备受瞩目的就是水队了，水队并非以输出能力的强势突出，而是强调攻守兼备的配置。水队的组合是罗兰、冬至、莉莉安、花凛，这套组合不仅战力强劲，其获取也十分容易，莉莉安在新手初始卡池中，可以直接抽取获得，花凛六元首充获取，如果你想零氪的话也可以拿其他的SR级辅助替代。冬至在维护补偿中免费赠送，现在已经达成人手一份了，罗兰的抽取难度可能就是这里面最高的了，需要拿初始号强抽获得。最后的主角选择干扰者职业来额外增加队伍的输出能力。
当然，条条大路通罗马，虽然水队是目前版本的主要强势体系，但其他的属性队也各有特色，并且不同于水属性的攻守均衡，在一些方面的表现中更为亮眼。
比如光属性队就是一个十分适合新手的队伍，组成是贝尔特朗、依法、地锦、灯，光属性有一个其他队伍所不具备的特性，那就是适用性。在悠久之树中的属性克制为火、风、土、水形成闭环克制关系，而光与暗两种属性不参与这四种属性的克制，而是互为克制关系，这样一来光和暗两种体系都不会遭到属性被克制打不出伤害的尴尬处境。光属性的主c是地锦，拥有多种debuff克制效果，还可以降低目标的防御，再配上多buff的增伤，实际输出能力要强于他们的面板表现。
风队的主要配置有罗莎莉、莲华、敏妮、希露提娅的配置，风队是伤害上限最高的队伍体系，几个角色都是以输出为主的，而风队的坦度则是依靠闪避，通过技能叠加闪避层数和概率，这样一来就不需要过多考虑生存能力，当然靠闪避的缺陷就是同时会比较依赖运气。
土队的配置上采用克莱纳、夏洛特、伊尼特，不过由于土队缺乏优秀辅助角色，所以可以选择暗属性的伊莎贝拉跨属性辅助，还能施加背水效果。实战中主要通过破甲能力来打出高伤害。相对来说土队显得有些平庸，角色之前技能不能形成很好的联动，需要玩家手动操作在不同的场景下使用特定的角色技能。
火队在当前版本中的强度不高，这是所有玩家接触悠久之树来的第一个属性，火队主要靠的是加拉哈德的技能无敌效果，可以强行挑战高坦度要求的副本，其余核心角色是莱妮哈露、萨米基娜、夏至。不过目前版本而言并不推荐火队，其输出核心莱妮哈露的上限并不高，而从阵容配置要求而言，火队也并非是一个低配队。
暗队的战斗方式则是需要压血线，很多暗属性角色都有背水的技能机制，在低血量的情况下可以造成更高的伤害。暗队有一个核心C位是芙落蕾娅，芙落蕾娅的单体输出能力极强，还拥有斩杀和梦魇效果造成额外伤害，辅助位则是伊莎贝拉，这个强力辅助角色在很多队伍体系都有出场机会，是一个万金油辅助，也是背水的核心角色。不过同样暗队在伤害上限不高，生存能力相比拥有闪避的风队也要弱，所以同样不推荐主玩。
